在純化的最后階段，目標(biāo)是蛋白質(zhì)的濃度為克每升水平，同時(shí)內(nèi)毒素的濃度為微克每升左右，這種情況常常會(huì)類似于大海撈針一樣的勞而無獲。

檢測(cè)這些低濃度的內(nèi)毒素也是一個(gè)問題，往往很難在納克每升水平應(yīng)用一般的常規(guī)方法直接檢測(cè)出來。據(jù)許多尚未正式報(bào)道的資料表明，許多檢測(cè)到的成分起先被認(rèn)為是致熱性的新物質(zhì)，后來證實(shí)這些物質(zhì)的致熱活性的來源并不是這種物質(zhì)本身而是內(nèi)毒素。這是由于檢測(cè)技術(shù)的不敏感所造成的，所以要完-全清除內(nèi)毒素顯然是不可能的。

用來檢測(cè)內(nèi)毒素的生化試驗(yàn)有兔試驗(yàn)、鱟試驗(yàn)，雞胚致死性試驗(yàn)和半乳糖氨預(yù)處理小鼠致死性試驗(yàn)等。其中，鱟試驗(yàn)(LAL)是最為敏感和經(jīng)濟(jì)的一種檢測(cè)方法。LAL試驗(yàn)由Renrson于1985年創(chuàng)立，其原理是利用一種稱為鱟的海洋節(jié)肢動(dòng)物的血凝集系統(tǒng)。運(yùn)用這種方法在體外可檢測(cè)出0.02EU/ml水平的內(nèi)毒素。雖然LAL試驗(yàn)被認(rèn)為是檢測(cè)內(nèi)毒素的敏感而可靠的方法，但是許多物質(zhì)也會(huì)干擾凝聚過程而導(dǎo)致假陽性或假陰性結(jié)果。這些干擾通常與樣品的濃度有關(guān)，如果將所檢測(cè)的樣品溶解可以避免干擾，但是這樣又會(huì)降低試驗(yàn)的敏感性。當(dāng)然，有的時(shí)候?qū)τ谝恍?fù)雜的液體如血液、陽離子蛋白質(zhì)溶液和脂質(zhì)體包被的內(nèi)毒素等檢測(cè)也會(huì)偶爾失效。因此，尋找一種可行的、敏感的生化試驗(yàn)需要進(jìn)一步的研究，全血刺激試驗(yàn)是新近發(fā)展起來的一種檢測(cè)內(nèi)毒素的試驗(yàn)﹐目前尚在德國(guó)進(jìn)行有關(guān)方面的驗(yàn)證。